La FMB représente ses membres dans plusieurs Commissions officielles :
- Commission pour la surveillance des marchés publics
- Commission des mesures d’accompagnement (CMA)
- Commission tripartite pour l’économie
- Commission technique de l’indice genevois des prix de la construction
- Commission Administrative des Fondations Immobilières (CAFI)
- Conseil du transport privé professionnel de marchandises
- Conseil de surveillance du marché de l’emploi
- Conseil interprofessionnel pour la formation
- Fondation immobilière de droit public Emma Kammacher
- Forum d’Agglomération
- Fondation pour la formation professionnelle et continue (FFPC)
- Fondation pour la formation des adultes (IFAGE)
- Office cantonal des assurances sociales (OCAS)
- Sevrices Industriels de Genève (SIG)
- Métiers d’art Genève (MAG)