La FMB représente ses membres dans plusieurs Commissions officielles :
- Commission pour la surveillance des marchés publics
- Commission consultative sur les marchés publics
- Commission consultative cantonale pour l’aménagement du territoire (CAT)
- Commission des mesures d’accompagnement (CMA)
- Commission tripartite pour l’économie
- Commission technique de l’indice genevois des prix de la construction
- Commission Administrative des Fondations Immobilières (CAFI) : Commission des marchés
- Commission cantonale de protection contre le bruit
- Conseil du transport privé professionnel de marchandises
- Conseil de surveillance du marché de l’emploi
- Conseil interprofessionnel pour la formation
- Fondation immobilière de droit public Camille Martin
- Forum d’Agglomération